Thiết kế phòng sinh học phân tử được chia thành các phòng chính sau:

Phòng nhận xử lý mẫu

Máy ly tâm spindown
Máy Vortex
Máy ly tâm
Tủ an toàn sinh học
Tủ lạnh
Tủ âm sâu
Nồi hấp

Phòng tách chiết

Máy tách chiết tự động 32 mẫu
Máy ly tâm spindown
Máy Vortex
Máy ly tâm
Tủ an toàn sinh học
Tủ chuyển mẫu passbox

Phòng PCR và phân tích

Hệ thống sinh hóa – miễn dịch Alinity
PCR Biorad
Tủ lạnh
Tủ âm
Máy ly tâm spindown
Máy Vortex
Tủ PCR
Tủ chuyển mẫu passbox

Phòng pha mix

Tủ PCR
Tủ âm
Máy ly tâm spindown
Máy Vortex

Phòng đệm, phòng thay PPE

Quy trình làm việc trong phòng sinh học phân tử PCR để giảm thiểu khả năng tạp nhiễm

Phòng chuẩn bị hóa chất

Chuẩn bị PCR master mix, chia nhỏ master mix

↓

Phòng chuẩn bị mẫu

(a) Sơ chế mẫu (b) Tách chiết nucleic acids

↓

Phòng khuếch đại và phát hiện sản phẩm

(a) Chạy PCR (real-time PCR) trên máy luân nhiệt (b) Phát hiện sản phẩm

i. Điện di trên gel (PCR thường)

ii. Quan sát & phân tích kết quả trên máy (real-time PCR)

Thiết bị của phòng thí nghiệm PCR:

Để đảm bảo cho các bước trước PCR và sau khi chạy PCR được tách biệt, mỗi phòng cần có các thiết bị, hóa chất, dụng cụ… riêng và chỉ được sử dụng các vật dụng này trong phòng đó

1. Máy PCR/real-time PCR: Dùng riêng cho phòng khuếch đại

2. Máy ly tâm (centrifuge): Sử dụng máy ly tâm riêng cho chuẩn bị mẫu (tách chiết acid nucleids…) và phòng chuẩn bị hóa chất (optional)

3. Máy ly tâm kéo mẫu (spindown): Sử dụng riêng máy spindown cho phòng chuẩn bị hóa chất, phòng chuẩn bị mẫu, phòng khuếch đại và phát hiện sản phẩm

4. Máy trộn mẫu (vortex mixer): Sử dụng riêng máy vortex cho phòng chuẩn bị hóa chất, phòng chuẩn bị mẫu, phòng khuếch đại và phát hiện sản phẩm

5. Bộ điện di DNA (DNA gel electrophoresis): Dùng để phát hiện sản phẩm sau khi chạy PCR, multiples PCR, RT-PCR…

6. Pipettes: Sử dụng riêng các bộ pipette cho phòng chuẩn bị hóa chất, phòng chuẩn bị mẫu, phòng khuếch đại và phát hiện sản phẩm

7. Tủ thao tác / tủ an toàn sinh học (Biological safety cabinets): Nên sử dụng tủ thao tác phù hợp với nhu cầu của phòng thí nghiệm (theo thiết kế của nhà sản xuất)